Syöpä: Nämä 4 geeniä auttavat ennustamaan lopputuloksen
Laaja tutkimus tuumorisuppressorin p53 roolista tarjoaa paremman käsityksen geneettisistä mutaatioista, jotka ovat pelissä eri syöpämuodoissa, sekä tunnistamalla neljä geeniä, jotka voivat auttaa ennustamaan henkilön näkymiä.
TP53 geeni on vastuussa koodaamisesta, mitä tutkijat kutsuvat kasvainproteiiniksi p53 - tuumorisuppressori, joka voi estää soluja jakautumasta ja lisääntymästä liian nopeasti.
Tutkijat ovat kopioineet TP53 "genomin vartija", koska sillä on ratkaiseva rooli kasvainten estämisessä ja solujen jakautumisen hallinnassa.
Ihmisen syöpiin liittyy usein mutaatioita TP53 geeni, jolloin yksi kriittisistä syövän torjuntamekanismeista epäonnistuu.
Ensimmäiset tunnistetut tutkimukset TP53 ihmisen syöpien mutaatiot ilmestyivät 1980-luvulla, ja siitä lähtien tutkijat ovat käyttäneet paljon aikaa ja resursseja selvittääkseen rooliaan syövässä.
Suurin lajissaan käytetty tutkimus käyttää kasvainnäytteitä yli 10000 syöpäpotilaalta ja tarkastelee 32 erilaista syöpää ymmärtääkseen paremmin TP53.
Larry Donehower, molekyylivirologian ja mikrobiologian professori Baylor College of Medicineissa Houstonissa, TX, johti uutta tutkimusta, joka ilmestyi lehdessä Soluraportit.
Telltale 4 -geenit voivat auttaa ennustamaan näkymiä
Tohtori Donehower ja työryhmä käyttivät viittä erilaista tietoalustaa saadakseen 10 225 näytettä 32 syövästä. Tutkijat pystyivät Cancer Genome Atlas (TCGA) -sovelluksen avulla arvioimaan kattavasti p53-reitin roolin näissä 32 syövässä.
Donehower ja hänen kollegansa vertasivat sitten TCGA-tietoja toiseen 80 000 geneettisen mutaation tietokantaan, jonka tohtori Thierry Soussi - molekyylibiologian professori Pariisin Sorbonnen yliopistossa Ranskassa - oli koonnut 30 vuoden aikana.
Tutkijat havaitsivat sen TP53 mutaatioita esiintyi useammin ihmisillä, joilla oli huonommat näkymät. Lisäksi analyysissä todettiin, että ”Yli 91% syöpistä TP53 mutaatiot osoittavat molempien toiminnallisten menetysten TP53 alleelit ”tai geenimuunnelmat.
Tohtori Donehower selittää: "Joissakin syöpägeeneissä näet yhden kopion kahdesta geenistä kadonnut tai mutatoitunut", mutta "yli 91 prosenttia kaikista syöpistä menettää molemmat TP53 geenit, ei vain yksi. "
Toinen alleelihäviö, kirjoittavat kirjoittajat, tapahtui "mutaation, kromosomaalisen deleetion tai kopio-neutraalin heterotsygoottisuuden menetyksen" kautta - toisin sanoen geenien päällekkäisyyden kautta. Johtava tutkija huomauttaa myös, että tämä viimeinen prosessi tapahtui paljon useammin kuin he aiemmin uskoivat.
Tärkeää on, että tutkimuksessa tunnistettiin myös neljä geeniä, jotka osoittivat yliekspressiota mutanteissa TP53 kasvaimet. Tutkijoiden mukaan nämä neljä geeniä voivat "kertoa", onko syöpäpotilaalla hyvät näkymät vai ei.
"Jos sinulla on korkea näiden neljän geenin ilmentymä, sinulla on potilas, jolla on todennäköisempi huono ennuste […]. Toisaalta, jos kyseisellä potilaalla on hyvin heikko näiden geenien ilmentymä, hän todennäköisesti selviää pidempään ja hänellä on hyvä ennuste. "
Tohtori Larry Donehower
"Se antaa sinulle paremman kuvan siitä, miten hänellä menee, kuin vain tietää, onko hän mutantti TP53 vai ei ”, jatkaa tohtori Donehower.
Lopuksi, tutkimus liittyy vahvasti TP53 mutaatiot, joilla on genominen epävakaus, havainto, joka on yhdenmukainen TP53Tyypillinen rooli "genomin vartijana".
Tohtori Donehower kommentoi uuden tutkimuksen ainutlaatuisuutta sanoen: ”Useimmat tutkimukset TP53 keskittyä yhteen syöpätyyppiin. "
"Tarkasteltaessa 32 erilaista syöpätyyppiä näet, että tietyt mallit pysyvät yllä syöpätyypistä riippumatta."
Baylor College of Medicine -tutkimuksen toinen kirjoittaja ja syöpägenomiikan johtaja, tohtori David Wheeler, kommentoi myös havaintojen merkitystä.
Hän sanoo: ”Siitä lähtien TP53 on yksi tärkeimmistä portinvartijoista syövän ehkäisyssä, mitä paremmin ymmärrämme tämän geenin, sitä paremmin pystymme ymmärtämään syövän perusbiologiaa. Se johtaa parempiin hoitomuotoihin. "
