Eturauhassyöpä: Suuret tiedot avaavat 80 uutta lääkekohdetta
Suurimmassa eturauhassyövän genetiikkaa analysoivassa tutkimuksessa tutkijat löytävät vähintään 80 uutta potentiaalista lääkekohdetta. Hanke avaa laajat mahdollisuudet uusien hoitojen suunnitteluun.
Geneettisen datan poimiminen oli aikoinaan hankala ja uskomattoman aikaa vievä tehtävä.
Teknologian kehittyessä työstä on kuitenkin tullut huomattavasti nopeampaa ja halvempaa.
Samanaikaisesti käytettävissä olevat työkalut suurten tietojoukkojen käsittelyyn ovat parantuneet huomattavasti.
Yhdessä tämä tarkoittaa sitä, että geneettisestä koodista kerätyt valtameret voidaan analysoida, kartoittaa ja yhdistää suhteellisen helposti uuden selkeyden aikaansaamiseksi.
Äskettäin kansainvälinen ryhmä käytti tätä DNA-analyysin ja suurten tietojen kaksisuuntaista lähestymistapaa kaivamaan eturauhassyövän genetiikkaa. Taudin panssarien molekyylisinkkien metsästyksessä tutkimuksen johtajana toimi Institute of Cancer Research Lontoossa, Iso-Britanniassa.
Eturauhassyövän haasteet
Eturauhassyöpä on toiseksi yleisin syöpä miesten keskuudessa Yhdysvalloissa. Tänä vuonna Yhdysvalloissa on arvioitu 164690 uutta eturauhassyövän tapausta ja melkein 30 000 taudin kuolemaa.
Vaikka tutkijat ovat edenneet eturauhassyövän ymmärtämisessä ja hoidossa, on vielä useita vaikeuksia.
Tutkimuksen johtaja professori Rosalind Eeles kertoo: "Yksi haasteista, joita kohtaamme syöpätutkimuksessa, on taudin monimutkaisuus ja suuri määrä tapoja, joilla voimme mahdollisesti hoitaa sitä."
Tohtori Justine Alford, Cancer Research UK, hahmottaa toisen kysymyksen eturauhassyövän tutkimiseen ja siihen puuttumiseen.
"Suurin este etenemissyövän torjumiselle on edelleen", hän selittää, "on se, ettei ole tapoja ennustaa tarkasti ihmisen taudin etenemistä, mikä tekee haastavaksi tietää, mikä hoito on parasta jokaiselle potilaalle."
Geneettisten tietojen kerääminen
Lähestyäkseen ongelmaa uudesta suunnasta tutkijat ottivat geneettisen tiedon 112 eturauhassyöpää sairastavalta mieheltä ja yhdistivät sen useiden muiden tutkimusten tietoihin. Kaiken kaikkiaan käytettiin 930 potilaan näytteitä.
Viimeisimpien big data -tekniikoiden avulla joukkue sai uuden oivalluksen geneettisistä muutoksista, jotka herättävät eturauhassyövän kehittymistä ja edistävät etenemistä. Kun he ovat ymmärtäneet mukana olevat geenit, he voivat luoda kartan proteiineista, joita nämä geenit koodaavat.
Seuraavaksi he kääntyivät canSAR-nimiseen tietokantaan, joka yhdistää tutkimusten tietoja, soveltaa koneoppimista ja auttaa antamaan tietoa huumeiden löytämisestä.
CanSAR selittää verkkosivustollaan kysymyksiä, joihin heidän tietokantansa pyrkii vastaamaan: "Mitä proteiinista tiedetään, missä syöpissä se ilmentyy tai mutatoituu, ja millä kemiallisilla työkaluilla ja solulinjomalleilla voidaan kokeilla sen aktiivisuutta? Mitä tiedetään lääkkeestä, sen soluherkkyysprofiilista ja mitä proteiineja sen tiedetään sitovan, mikä voi selittää epätavallisen bioaktiivisuuden? "
Tutkijat havaitsivat, että 80 heidän paljastamastaan proteiinista oli potentiaalisia lääkekohteita. Ja 11 näistä kohdennettiin olemassa olevilla lääkkeillä, ja seitsemään muuhun lääkkeisiin voitiin kohdistaa jo kliinisissä tutkimuksissa.
Heidän havainnot julkaistaan tällä viikolla lehdessä Luonnon genetiikka.
"Tutkimuksessamme käytettiin huipputekniikoita big data -analyysissä saadaksemme runsaasti uutta tietoa eturauhassyövästä ja mahdollisista tavoista taudin torjumiseksi."
Professori Rosalind Eeles
Katse tulevaisuuteen
Löytöt edellyttävät lisätutkimuksia, ennen kuin niitä voidaan tietysti käyttää kliinisesti, mutta ne tarjoavat joukon uusia mahdollisuuksia.
Kuten toinen kirjoittaja professori Paul Workman selittää: "Tämä tutkimus on paljastanut huomattavan suuren määrän uusia geenejä, jotka ohjaavat eturauhassyövän kehittymistä, ja antanut meille elintärkeää tietoa taudin biologian hyödyntämisestä mahdollisten uusien hoitojen löytämiseksi. ”
Hän toivoo, että heidän työnsä "stimuloi uuden tutkimuksen aivoja geneettisiin muutoksiin ja potentiaalisiin huumekohteisiin, jotka he ovat tunnistaneet. Tavoitteena on, että potilaat hyötyvät siitä mahdollisimman pian".
Toinen kompastuskivi eturauhassyövän hoitojen suunnittelussa on tapa, jolla tauti etenee eri tavoin kussakin yksilössä. Tämän vuoksi on paljon vaikeampaa päättää, mitkä hoitovaihtoehdot sopivat parhaiten kullekin potilaalle.
Tohtori Alford toivoo, että "[parantaa] suuresti ymmärrystä taudin takana olevasta genetiikasta, […] tulevaisuudessa tämä tieto voi auttaa lääkäreitä räätälöimään paremmin hoidot yksilön syöpään ja toivottavasti näkemään enemmän ihmisiä selviytyvän sairaudestaan. ”
Nämä ovat alkuvaiheita, mutta seuraavan tutkimuksen sukupolven tulokset voivat olla transformoivia kentälle.
