Syöpä: Tutkijat löytävät 129 `` hyppää geeniä '', jotka ohjaavat kasvaimen kasvua
Syöpätutkimuksessa tutkijat etsivät yleensä syöpägeenejä pyyhkimällä genomista DNA: n muuttuneet sekvenssit - tai mutaatiot. Mutta uusi tutkimus on nyt paljastanut, että hyppygeenit, joista tavanomainen sekvensointi unohdetaan, ovat myös tärkeitä kasvaimen kasvun ajureita.
Washingtonin yliopiston lääketieteellisen korkeakoulun tutkijat St. Louisissa, MO, havaitsivat, että hyppygeenit ovat levinneet syöpään ja edistävät kasvaimen kasvua pakottamalla syöpägeenit pysymään päällä.
He analysoivat 7769 kasvainnäytettä 15 eri syöpätyypistä ja löysivät 129 hyppygeeniä, jotka voivat ajaa kasvaimen kasvua vaikuttamalla 106 eri syöpigeeniin.
Hyppygeenit toimivat "varkaina kytkiminä" 3 864: ssä tuumoreista, joita ryhmä analysoi. Nämä kasvaimet tulivat rinta-, paksusuoli-, keuhko-, iho-, eturauhas-, aivo- ja muuntyyppisistä syövistä.
Äskettäin Luonnon genetiikka paperi antaa täydellisen selvityksen tutkimuksesta.
Tunnistamalla hyppäävät geenit potentiaalisiksi geneettisiksi kohteiksi löydökset avaavat uuden maan uusien syöpähoitojen etsinnässä.
"Jos sinä", sanoo genetiikan laitoksen lääketieteen professori Ting Wang, "suoritat tyypillisen genomin sekvensoinnin etsimällä syöpää aiheuttavia geneettisiä mutaatioita, et löydä hyppyjä geenejä."
Monien geneettisten puolien tauti
Syöpä kehittyy, kun geneettiset ohjeet, jotka säätelevät solujen toimintaa, erityisesti niiden kypsymistä ja jakautumista, käyvät läpi tiettyjä muutoksia.
Jotkut syöpää aiheuttavista geneettisistä muutoksista muuttavat kehon luonnollisia solukasvun reunakiveyksiä; toiset saattavat häiritä proteiinien rakennetta ja toimintaa, jotka suorittavat solujen työn ja pitävät ne kunnossa.
Geneettiset muutokset, jotka voivat aiheuttaa syöpää, voivat siirtyä vanhemmalta lapselle. Ne voivat syntyä myös ihmisen elinaikana, kuten solujen jakautumisen aikana, tai vastauksena ultraviolettisäteilyyn, tupakansavussa oleviin syöpää aiheuttaviin aineisiin tai muihin ympäristötekijöihin.
Geneettisiä muutoksia on erityyppisiä. Jotkut vaikuttavat vain yhteen DNA: n rakennuspalikkaan, kun taas toiset voivat kopioida, jättää pois tai järjestää pitkät rakennuspalikat.
Toinen tapa, jolla geneettiset muutokset voivat johtaa syöpään, ei muuta itse DNA: ta, vaan muuttaa sen kykyä ilmaista ohjeita. Tämän tyyppistä muutosta kutsutaan epigeneettiseksi. Yksi tapa, jolla se tapahtuu, on kemiallisten tunnisteiden avulla, jotka kiinnittyvät DNA: han.
On normaalia, että jopa terveillä soluilla on geneettisiä muutoksia, mutta syöpäsoluilla on yleensä paljon enemmän näitä. Jokaisen ihmisen syöpällä on oma geneettisten muutosten mallinsa, ja jopa samassa kasvaimessa eri soluilla voi olla erilaiset geneettiset sormenjäljet.
Hyppygeenit - uudentyyppinen kuljettaja
Hyppygeenit, joita tutkijat kutsuvat siirrettäviksi elementeiksi, ovat DNA-sekvenssejä, jotka voivat liikkua genomissa. Niitä "tulee monissa eri muodoissa", ja tutkijat tarvitsevat erikoistuneita työkaluja niiden analysointiin.
Parannettujen ja tehokkaiden tekniikoiden ansiosta tutkijat ymmärtävät, että hyppygeenit ovat hyvin aktiivisia genomissa ja että ehkä "niitä ei pitäisi enää syrjäyttää".
Kuinka hyppäävät geenit pääsivät ihmisen genomiin evoluution aikana, on kuuma kysymys. Jotkut ihmiset ovat väittäneet, että virusinfektio on ollut yleinen reitti.
Aikaisemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että hyppy-geenien erityiset elementit voivat vaikuttaa syöpägeenien ilmentymiseen. Nämä eivät kuitenkaan ole tutkineet tällaisia tapahtumia yksityiskohtaisesti tai tutkineet, kuinka yleisiä ne saattavat olla erilaisissa syöpissä.
Joten, professori Wang ja hänen tiiminsä päättivät käsitellä näitä seikkoja käyttämällä kasvainnäytteitä Cancer Genome Atlas -ohjelmasta.
He havaitsivat, että hyppygeenit ovat ominaisuus monille syöpien nopeutetuille kasvaimille.
Näyttää siltä, että näissä aggressiivisemmissa syövissä hyppygeenit käyttäytyvät ”salakytkiminä”, jotka kytkevät päälle syöpään liittyvät geenit, jotka ovat yleensä hiljaisia - ja pitävät ne päällä.
Hyppygeenit vaihtelevat syöpätyypeittäin
Tutkimuksen kriittinen havainto on, että vaikka hyppygeenit näyttävät olevan levinneitä syövässä, niiden läsnäolo ja vaikutusmallit vaihtelevat syöpätyypeittäin.
Ryhmä havaitsi esimerkiksi, että 12 prosentilla gliooma-aivosyövistä oli vähintään yksi hyppygeeni, kun taas tämä luku oli 87 prosenttia keuhkosyöpätyypille, jota kutsutaan okasolusyöpäksi.
"Hyppygeenit ovat tärkeämpiä joissakin syöpätyypeissä verrattuna muihin, mutta keskimäärin havaitsimme ainakin yhden niistä aktivoivan syöpägeenin noin puolessa kaikista tutkituista kasvaimista", professori Wang selittää.
Hän ehdottaa, että tällaisten tietojen antaminen lääkäreille voisi auttaa heitä päättämään, hoidetaanko tiettyjä syöpiä "aggressiivisemmin".
"Se tarjoaa myös uusia tavoitteita tutkia tulevia syöpähoitoja", hän lisää.
Toinen tärkeä havainto oli, että piilevinä kytkiminä toimivat hyppygeenit olivat yleisempiä syöpissä, joiden DNA-muoto oli avoimempi. Genomi pitää tyypillisesti DNA: n tiiviisti suljettuna. Avomuotoinen DNA menettää todennäköisemmin osan toiminnastaan.
”Paljon siitä, mitä siirrettäviä elementtejä genomissamme tekee, on edelleen mysteeri. Tämä tutkimus on ensimmäinen yksityiskohtainen kuvaus heidän tärkeistä rooleistaan syövässä. "
Professori Ting Wang
