Herpesinfektioiden ehkäisy: Tutkimus tarjoaa uusia oivalluksia
Uusi tutkimus tunnistaa avainkertoimen, joka määrittää herpesviruksen etenemisen, ja osoittaa, että sen kohdentaminen voi hidastaa viruksen etenemistä.
Tautien torjunnan ja ennaltaehkäisyn keskusten (CDC) tuoreimpien tilastojen mukaan vuosina 2015–2016 Yhdysvalloissa lähes 48% ihmisistä asui herpes simplex 1: llä, viruskannalla, joka aiheuttaa suun infektioita.
Maailmassa 80%: lla väestöstä on virus. Kun henkilö on saanut tartunnan, virus ei koskaan poistu - se pysyy lepotilassa kehossaan koko elämänsä ajan.
Vaikka herpesoireet joskus jäävät huomaamatta, joillekin ihmisille ne voivat olla epämiellyttäviä ja tuskallisia.
Herpesvirus on myös erittäin tarttuvaa, koska henkilö voi siirtää sen edelleen, vaikka heillä ei ole oireita.
Uudet tutkimukset viittaavat siihen, että viruksen tarttuminen saattaa pian olla estettävissä, koska tutkijat tarjoavat uusia oivalluksia siitä, mitä tapahtuu solutasolla herpesinfektion aikana, ja löytävät keinon hidastaa infektion etenemistä.
Emanuel Wyler, Ph.D. ja Vedran Franke, Ph.D., Berliinin lääketieteellisen systeemibiologian instituutista, Saksasta, ovat uuden lehden, joka ilmestyy lehdessä. Luontoviestintä.
NRF2-transkriptiotekijän merkitys
Tutkijat kehittivät algoritmin, jonka avulla he pystyivät ennustamaan infektion etenemisen yksittäisissä soluissa.
Tutkijat käyttivät yksisoluista RNA-sekvensointia analysoimaan 12 000 herpes simplex -viruksella 1 (HSV1) infektoitunutta ihmisen ihosolua. Yksisoluisen RNA: n sekvensointi on vallankumouksellinen tekniikka, joka sallii geneettisten ilmentymien hajottamisen paljon rakeisemmalla tasolla kuin massan RNA-sekvensointi.
Tutkijat selittävät eron yksisoluisen RNA-sekvensoinnin ja tavanomaisen, bulkkisen RNA-sekvensoinnin välillä käyttämällä smoothie-analogiaa.
"Jos laitan kymmenen hedelmää sekoittimeen, voin sanoa karkeasti, että smoothie sisältää esimerkiksi karhunvatukoita, kun maistan sitä", Wyler selittää. "Yksisoluisella RNA-sekvensoinnilla emme tee smoothieta - teemme hedelmäsalaattia. Voin heti tunnistaa karhunvatukat ja sanoa tarkalleen kuinka monta salaatissa on. "
Tekniikka yhdessä algoritmin kanssa paljasti tutkijoille, että NRF2-nimisellä transkriptiotekijällä on keskeinen rooli, ja sen aktivaatio estää infektion etenemisen.
Transkriptiotekijät ovat proteiineja, jotka “purkavat” tietoa genomistamme ja aktivoivat tai deaktivoivat tiettyjä geenejä sitoutumalla tiettyihin DNA-alueisiin.
Franke selittää, kuinka uusi tekniikka paljasti NRF2-transkriptiotekijän merkityksen.
"Visualisoin muutokset tutkittujen geenien säätelyssä yhdessä solussa", hän sanoo. "Tämä osoitti meille, että NRF2-transkriptiotekijän aktivaatiotaso voi olla merkki väliaikaisesta resistenssistä HSV1-infektiolle."
Tutkijat havaitsivat myös, että kaksi NRF2-agonistia tai aktivaattoria, joita kutsutaan bardoksolonimetyyliksi ja sulforafaaniksi, heikentävät viruksen tuotantoa, toisin sanoen ne saavat viruksen aktivoimaan vähemmän omia geenejään. Tämä vahvisti tutkijoille NRF2: n keskeisen roolin.
Bardoksolonimetyyli on lääke, joka on suunniteltu kroonisen munuaisinfektion hoitoon. Se on tällä hetkellä kliinisten tutkimusten kolmannessa vaiheessa.
Lopuksi tutkimus paljasti myös, että solusyklin vaihe vaikuttaa myös siihen, kuinka herkkä solu on HSV1-infektiolle.
Tutkijat selittävät, että herpesvirus on hyvä "yleinen suunnitelma" solutilojen tutkimiseksi virusinfektioissa, ja he aikovat käyttää yksisoluisen RNA-sekvensoinnin tulevien virusten tutkimiseen.
