Suurin mikrobiomitutkimus painaa suoliston terveyttä
Ensimmäiset tulokset ihmisen mikrobiomista koskaan suurimmasta tutkimuksesta ovat. Ne vaikuttavat merkittävästi ruokavalioon, antibioottien vastustuskykyyn ja mielenterveyteen.
Vuonna 2012 Rob Knight, Ph.D., Kalifornian yliopistosta (UC), San Diego, Jeff Leach, Ph.D., Human Food Projectin perustaja, ja Jack Gilbert, Ph.D., joka on Illinoisin Chicagon yliopiston mikrobiomikeskuksen tiedekunnan johtaja lähti perustamaan American Gut Project.
Projektin tavoitteena oli oppia lisää ihmisen mikrobiomista - eli koko mikrobiamme koodaavasta geenikokoelmasta.
Tutkijat halusivat tietää, kuinka monta bakteerityyppiä elää kehossamme ja missä, ja miten ruokavalio ja elämäntapa vaikuttavat näiden mikrobien koostumukseen.
Tätä varten he käyttivät niin sanottua kansantieteitä - käytäntöä, jossa yleisö osallistuu tutkimukseen tarjoamalla aikaa ja henkilötietoja analysoitavaksi.
Projektin ensimmäiset tulokset ovat nyt saatavilla, ja ne tarjoavat vihjeitä siitä, mikä pitää suolemme terveinä ja bakteerien monimuotoisina. Tulokset julkaistiin lehdessä mSystems.
Kansalaiset tutkijat auttavat tutkimaan mikrobiomia
Osana projektia osallistujat maksoivat 99 dollaria paketista, joka keräsi ulosteen, suun ja ihonäytteitä bakteereista.
Heidän oli myös vastattava kyselyyn, jossa kysyttiin heidän yleisestä terveydestään ja mahdollisista sairauksistaan, elämäntavoistaan ja ruokavaliosta.
Vuonna 2015 projektissa laskettiin 15 096 näytettä, jotka toimittivat 11 336 ihmistä eri puolilta Yhdysvaltoja, Iso-Britannia, Australia ja 42 muuta maata.
Sitten tutkijat käyttivät genomista sekvensointia analysoimaan geneettisen markkerin nimeltä 16S rRNA, joka on bakteereille ainutlaatuinen molekyyli.
He tutkivat myös näytteissä olevien metaboliittien joukkoa muiden läsnä olevien molekyylien ja kemiallisten yhdisteiden analysoimiseksi.
Lopuksi tutkijat käyttivät menetelmää nimeltä haulikon metagenomiikka - joka on innovatiivinen ja tehokas DNA-sekvensointimenetelmä - geneettisten tietojen kattavaan analysointiin.
Monipuolisen, kasvipohjaisen ruokavalion merkitys
Ensinnäkin tulokset viittaavat siihen, että monipuolisempi kasvipohjainen ruokavalio muodostaa bakteereiltaan monimuotoisemman suoliston.
Erityisesti niillä, jotka kuluttivat yli 30 erityyppistä kasvia viikossa, oli paljon monimuotoisempia mikrobiomeja kuin niillä, jotka kuluttivat vain 10 tai vähemmän kasvilajia viikoittain.
Tutkijat huomauttavat kuitenkin, että nämä tulokset eivät välttämättä tarkoita sitä, että mikrobien monimuotoisuuden lisääntyminen on positiivista jonkun terveydelle.
Toiseksi osallistujilla, jotka ilmoittivat syövänsä yli 30 kasvilajia viikossa, näytti olevan alhaisempi vastustuskyky antibiooteille.
Tutkijat löysivät näiden ihmisten ulostenäytteistä vähemmän geenejä, jotka osoittavat antibioottiresistenssin - toisin sanoen vähemmän geenejä, jotka auttavat bakteereja pääsemään huumeista.
Vaikka tutkimus on puhtaasti havainnoiva eikä voinut päätellä mitään syy-yhteydestä, kirjoittajat spekuloivat, että henkilöt, joiden ruokavalio sisältää vähemmän kasveja, voivat kompensoida joko lihan - jota on ehkä hoidettu antibiooteilla - tai jalostettujen elintarvikkeiden, joihin on lisätty antibiootteja, syömistä. .
Suolibakteerit ja mielenterveys
Lopuksi tutkimus paljasti mielenkiintoisia yhteyksiä suoliston bakteerien koostumuksen ja mielisairauksien välillä.
Niitä, jotka ilmoittivat elävänsä traumaperäisen stressihäiriön (PTSD), skitsofrenian, masennuksen tai kaksisuuntaisen mielialahäiriön kanssa, verrattiin terveisiin verrokkeihin, joiden ikä, sukupuoli ja painoindeksi (BMI) oli sovitettu yhteen.
Tulokset osoittivat, että ihmisillä, jotka ilmoittivat mielenterveysongelmista, oli enemmän yhteisiä bakteereja muiden ihmisten kanssa, jotka ilmoittivat samanlaisista ongelmista kuin kontrollien yhteydessä.
Tämä yhteys oli vahva sukupuolesta, iästä tai maantieteellisestä sijainnista riippumatta. Lisäksi tutkimus viittaa siihen, että jotkut bakteerityypit voivat olla yleisempiä masennuksessa elävillä ihmisillä.
Nämä havainnot vahvistavat mielenterveyden ja suolistobakteerien välistä yhteyttä aikaisemmissa tutkimuksissa.
Esimerkiksi äskettäin tehty tutkimus korosti yhteyttä ahdistuksen ja tiettyjen terveiden suolimikrobien puuttumisen välillä. Toinen havaitsi, että tietyt bakteerit ovat muuttuneet PTSD-potilailla.
Kohti ”mikrobiomi GPS: ää”
UC San Diegon lääketieteellisen koulun amerikkalaisen suolistoprojektin tieteellinen johtaja, Daniel McDonald, Ph.D., punnitsee löydösten merkitystä. Hän sanoo:
"Havaitsimme paljon suuremman mikrobien monimuotoisuuden kuin aikaisemmat pienemmät tutkimukset löysivät, mikä viittaa siihen, että jos tarkastelemme enemmän populaatioita, näemme enemmän monimuotoisuutta, mikä on tärkeää ihmisen mikrobiomin rajojen määrittelemiseksi."
Knightilla on samanlainen mielipide sanoen: "Ihmisen mikrobiomi on monimutkainen, mutta mitä enemmän näytteitä saamme, sitä nopeammin pystymme selvittämään mikrobiomin moninaiset yhteydet erilaisiin terveys- ja tautitiloihin."
"American Gut Project on dynaaminen, näytteitä saapuu ympäri maailmaa päivittäin", Knight lisää.
"Tässä artikkelissa esitetty analyysi edustaa yhtä tilannekuvaa, mutta haluamme lopulta mennä mikrobiomin karttojen tekemisen ulkopuolelle mikrobiomi-GPS: n valmistamiseen, joka kertoo sinulle, missä olet tällä kartalla, mutta minne haluat mennä ja mitä tehdä päästäksesi sinne ruokavalion, elämäntavan tai lääkkeiden suhteen. "
Rob Knight, Ph.D.
